41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001439 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  84.47 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  71.57 
 
 		 106 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  65.35 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  53 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  53 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  56.57 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  54.17 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  54.17 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  59 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  45.92 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  45.63 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  44.9 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  45.92 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  45.63 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  38.83 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  35.16 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  31.87 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  39.36 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  33.66 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  38 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  40.24 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  39.06 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  28.87 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34.09 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  31.51 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  41.58 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  35.94 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  30.48 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>