248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001154 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  100 
 
 
224 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2523  fructose-6-phosphate aldolase  55.3 
 
 
220 aa  244  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0975  fructose-6-phosphate aldolase  54.84 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0896  fructose-6-phosphate aldolase  54.84 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2817  transaldolase  54.38 
 
 
220 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2819  fructose-6-phosphate aldolase  54.38 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00792  fructose-6-phosphate aldolase 1  54.38 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00809  hypothetical protein  54.38 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0883  fructose-6-phosphate aldolase  54.38 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0850  fructose-6-phosphate aldolase  53.92 
 
 
220 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1319  fructose-6-phosphate aldolase  54.38 
 
 
220 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144476  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4515  fructose-6-phosphate aldolase  53 
 
 
220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4441  fructose-6-phosphate aldolase  53 
 
 
220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.933365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4444  fructose-6-phosphate aldolase  53 
 
 
220 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4326  fructose-6-phosphate aldolase  52.53 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4357  fructose-6-phosphate aldolase  52.53 
 
 
220 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  52.97 
 
 
221 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  50.68 
 
 
221 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  50.68 
 
 
221 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  50 
 
 
242 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03832  fructose-6-phosphate aldolase 2  52.07 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03781  hypothetical protein  52.07 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4181  fructose-6-phosphate aldolase  52.07 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4486  fructose-6-phosphate aldolase  51.61 
 
 
220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4039  transaldolase  51.61 
 
 
220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4394  fructose-6-phosphate aldolase  51.61 
 
 
220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4069  fructose-6-phosphate aldolase  51.61 
 
 
220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5407  fructose-6-phosphate aldolase  51.61 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4433  fructose-6-phosphate aldolase  51.15 
 
 
220 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  47.09 
 
 
222 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3551  fructose-6-phosphate aldolase  44.24 
 
 
221 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1068  Transaldolase  41.36 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000767665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0332  fructose-6-phosphate aldolase  38.71 
 
 
222 aa  161  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1939  Transaldolase  36.99 
 
 
227 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  33.18 
 
 
216 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  34.91 
 
 
221 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  33.49 
 
 
216 aa  150  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  34.98 
 
 
226 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  34.91 
 
 
213 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  32.39 
 
 
215 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  36.36 
 
 
215 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  32.7 
 
 
213 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  33.49 
 
 
215 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  33.8 
 
 
222 aa  141  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  33.33 
 
 
215 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  33.49 
 
 
213 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  31.34 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  32.55 
 
 
216 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  31.02 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  32.09 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  32.55 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  31.46 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  30.88 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  31.92 
 
 
218 aa  138  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  33.02 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  31.92 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  31.6 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  30.33 
 
 
215 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  31.6 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  31.28 
 
 
213 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  32.08 
 
 
214 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  35.05 
 
 
216 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  32.87 
 
 
246 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  30.52 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  33.18 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  30.73 
 
 
217 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  31.82 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  32.41 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  33.96 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  33.96 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  33.96 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  32.23 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  29.77 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  30.99 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  32.23 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  31.13 
 
 
214 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0761  putative transaldolase  32.41 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  30.81 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  31.75 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  35.38 
 
 
219 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  33.02 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  30.19 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  33.02 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  32.69 
 
 
218 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  31.94 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  30.37 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  32.06 
 
 
216 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  30.7 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  31.31 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  30.28 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  31.28 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  34.27 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  29.3 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0935  transaldolase  34.38 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0461  putative translaldolase  30.77 
 
 
220 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.541779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  30.99 
 
 
217 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  30.19 
 
 
215 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  30.19 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  30.19 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  30.19 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>