More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4515 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4515  fructose-6-phosphate aldolase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4441  fructose-6-phosphate aldolase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.933365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4357  fructose-6-phosphate aldolase  99.55 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4444  fructose-6-phosphate aldolase  99.55 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4326  fructose-6-phosphate aldolase  99.09 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03832  fructose-6-phosphate aldolase 2  90 
 
 
220 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4039  transaldolase  89.55 
 
 
220 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4069  fructose-6-phosphate aldolase  89.09 
 
 
220 aa  380  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4486  fructose-6-phosphate aldolase  89.09 
 
 
220 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4394  fructose-6-phosphate aldolase  89.09 
 
 
220 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03781  hypothetical protein  90 
 
 
220 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4181  fructose-6-phosphate aldolase  90 
 
 
220 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5407  fructose-6-phosphate aldolase  88.64 
 
 
220 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4433  fructose-6-phosphate aldolase  88.18 
 
 
220 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  70.51 
 
 
221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1319  fructose-6-phosphate aldolase  68.18 
 
 
220 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144476  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2817  transaldolase  67.27 
 
 
220 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  66.36 
 
 
242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 
221 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  65.91 
 
 
221 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00792  fructose-6-phosphate aldolase 1  67.27 
 
 
220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0975  fructose-6-phosphate aldolase  66.82 
 
 
220 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0883  fructose-6-phosphate aldolase  67.27 
 
 
220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00809  hypothetical protein  67.27 
 
 
220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2819  fructose-6-phosphate aldolase  67.27 
 
 
220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0896  fructose-6-phosphate aldolase  66.82 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2523  fructose-6-phosphate aldolase  66.82 
 
 
220 aa  305  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0850  fructose-6-phosphate aldolase  66.36 
 
 
220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3551  fructose-6-phosphate aldolase  60.45 
 
 
221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  53 
 
 
224 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1068  Transaldolase  40.64 
 
 
227 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000767665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  40.38 
 
 
216 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1939  Transaldolase  39.27 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  37.85 
 
 
216 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  41.18 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  37.21 
 
 
213 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  36.97 
 
 
213 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  37.56 
 
 
216 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  36.79 
 
 
215 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  36.28 
 
 
215 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  36.97 
 
 
213 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  39.91 
 
 
215 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  37.04 
 
 
217 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  36.32 
 
 
221 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  39.81 
 
 
215 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  36.62 
 
 
214 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  38.68 
 
 
213 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0332  fructose-6-phosphate aldolase  38.43 
 
 
222 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  36.02 
 
 
215 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  36.97 
 
 
215 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  36.28 
 
 
215 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  35.85 
 
 
216 aa  152  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  36.15 
 
 
214 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  36.15 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  39.91 
 
 
217 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  36.62 
 
 
214 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  37.9 
 
 
217 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  35.94 
 
 
215 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  38.97 
 
 
217 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  34.25 
 
 
218 aa  147  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  39.91 
 
 
219 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  35.68 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  33.96 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  33.79 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  36.15 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  35.05 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  36.92 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  36.45 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  38.03 
 
 
221 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  36.32 
 
 
215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  38.5 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  34.91 
 
 
214 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  37.56 
 
 
215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  36.57 
 
 
218 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  37.56 
 
 
215 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  37.38 
 
 
219 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  34.74 
 
 
222 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  37.5 
 
 
246 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  37.44 
 
 
216 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  37.56 
 
 
215 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  37.09 
 
 
215 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  36.45 
 
 
220 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  37.04 
 
 
217 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  35.78 
 
 
218 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  36.65 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  36.07 
 
 
219 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  35.85 
 
 
217 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  37.56 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  35.21 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  34.1 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  39.81 
 
 
218 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  38.03 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  35.98 
 
 
216 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>