44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1444 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  45.05 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  37.61 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  37.39 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  37.72 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  31.56 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  30.26 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  31.93 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  29.25 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  34.04 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  26.94 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  27.98 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  29.51 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  26.05 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  26.86 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  26.73 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  24.84 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2851  hypothetical protein  26.59 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2542  hypothetical protein  26.59 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0704132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01559  hypothetical protein  25.85 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  22.87 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  22.58 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1801  hypothetical protein  22.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182005  normal  0.0371017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  23.56 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  26.01 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  25.57 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1131  hypothetical protein  58.33 
 
 		 207 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>