298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0257 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  65.2 
 
 		 687 aa  931    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  65.46 
 
 		 689 aa  940    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  64.29 
 
 		 688 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  64.88 
 
 		 689 aa  939    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  65.22 
 
 		 690 aa  933    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  64.29 
 
 		 688 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  65.2 
 
 		 687 aa  931    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  56.43 
 
 		 723 aa  818    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  56.43 
 
 		 723 aa  818    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  81.33 
 
 		 709 aa  1184    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  56.43 
 
 		 723 aa  817    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  81.69 
 
 		 696 aa  1209    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  64.29 
 
 		 688 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  54.73 
 
 		 690 aa  768    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  64.29 
 
 		 688 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  63.74 
 
 		 686 aa  944    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  65.2 
 
 		 687 aa  931    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  55.36 
 
 		 720 aa  815    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  50.36 
 
 		 695 aa  726    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  56.43 
 
 		 723 aa  817    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  55.38 
 
 		 694 aa  787    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  65.5 
 
 		 687 aa  932    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  55.06 
 
 		 720 aa  813    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  55.06 
 
 		 720 aa  813    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  63.99 
 
 		 688 aa  945    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  64.49 
 
 		 690 aa  922    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  55.2 
 
 		 720 aa  815    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  100 
 
 		 701 aa  1442    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  55.49 
 
 		 730 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  73.9 
 
 		 722 aa  1083    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  55.4 
 
 		 724 aa  812    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  64.14 
 
 		 688 aa  947    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  64.29 
 
 		 688 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  45.28 
 
 		 701 aa  615  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  44.43 
 
 		 684 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  43.45 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  43.44 
 
 		 692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  42.73 
 
 		 718 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.59 
 
 		 690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  36.31 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  38.1 
 
 		 687 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  39.5 
 
 		 679 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  36.48 
 
 		 715 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  36.86 
 
 		 882 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  36.61 
 
 		 712 aa  432  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  38.4 
 
 		 693 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  35.35 
 
 		 681 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  36.66 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  34.95 
 
 		 721 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  38.28 
 
 		 693 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  38.89 
 
 		 688 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  35.77 
 
 		 715 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  36.83 
 
 		 700 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  37.73 
 
 		 727 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  36.6 
 
 		 708 aa  422  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  36.27 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  35.67 
 
 		 693 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  37.27 
 
 		 712 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.8 
 
 		 720 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  37.1 
 
 		 712 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  34.92 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.23 
 
 		 722 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  35.23 
 
 		 722 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  34.16 
 
 		 710 aa  416  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  36.73 
 
 		 690 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  36.32 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  34.93 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  35.82 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  36.38 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  35.8 
 
 		 713 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  35.4 
 
 		 720 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  36.21 
 
 		 694 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  35.61 
 
 		 709 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  36.12 
 
 		 728 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  36.42 
 
 		 694 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  36.93 
 
 		 693 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  34.58 
 
 		 721 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  37.16 
 
 		 708 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  35.59 
 
 		 705 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  33.69 
 
 		 726 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  34.43 
 
 		 710 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  34.21 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  35.98 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  36.17 
 
 		 736 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  37.52 
 
 		 687 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  34.92 
 
 		 736 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  35.91 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  36.32 
 
 		 723 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  36.5 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  37.19 
 
 		 687 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  36.19 
 
 		 749 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  35.24 
 
 		 724 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  34.7 
 
 		 736 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>