32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0516 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  60.82 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  61.34 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  42.64 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000594  putative DamX-related protein  39.24 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  35 
 
 		 497 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  27.91 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.91 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  42.22 
 
 		 521 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  33.73 
 
 		 504 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  34.52 
 
 		 525 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  27.21 
 
 		 483 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  30 
 
 		 469 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  27.21 
 
 		 336 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  25.44 
 
 		 350 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.59 
 
 		 616 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  27.94 
 
 		 349 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  30.68 
 
 		 533 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  31.03 
 
 		 616 aa  45.1  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  31.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  27.5 
 
 		 483 aa  44.7  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  25.32 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  25.32 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  25.32 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 		 491 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  25.3 
 
 		 426 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  30.86 
 
 		 506 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  24.42 
 
 		 533 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  27.5 
 
 		 494 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  39.62 
 
 		 505 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  34.09 
 
 		 340 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>