More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0685 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0685  NusG family protein  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl091  transcription antitermination factor  27.05 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0114  transcription antitermination protein NusG  29.13 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf093  transcription antitermination protein NusG  29.46 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00871231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  25.43 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  27.03 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  23.35 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  25.11 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  24.89 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  26.01 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  24.89 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  27.15 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  24.22 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  26.01 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  24 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  23.56 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  24 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  24 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  25.56 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  23.77 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  25.11 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  28.83 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  25.56 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  24.22 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  26.87 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  24.22 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  26.87 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  26.01 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  24.22 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  24.89 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  24.44 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  25.56 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  23.56 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  22.57 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  29 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  24.66 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  24.44 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  24 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  26.43 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  23.32 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  27.78 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  25.68 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  24.44 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  23.4 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  24.56 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  24.22 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  22.98 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  23.87 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  23.42 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  25.56 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  24.35 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  23.87 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  24.77 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  22.81 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  24.44 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  22.81 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  23.45 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  23.21 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  23.08 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  23.21 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  23.77 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  23.42 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  21.52 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  23.77 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  22.62 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  26.91 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  23.32 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  21.78 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  23.32 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  24.55 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  24 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  23.77 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  27.03 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  23.08 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  21.62 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  24.45 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  21.97 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>