88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2362 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 287 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.53 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.67 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.49 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.84 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.67 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.92 
 
 		 229 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.82 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  36.89 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.85 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  28.39 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.48 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.27 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  23.36 
 
 		 210 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.6 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.98 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.23 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.37 
 
 		 666 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.3 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.85 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.22 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.64 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.73 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  30.22 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  23.79 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.14 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.6 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.18 
 
 		 207 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.8 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.24 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.02 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.29 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.56 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.65 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.65 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.19 
 
 		 616 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.19 
 
 		 616 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.92 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  25.37 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.79 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.11 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.11 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  23.75 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  23.75 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.92 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.11 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.12 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.46 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.51 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.75 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  24.2 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.55 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.62 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.56 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.2 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  23.5 
 
 		 216 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.34 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.88 
 
 		 672 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  29.23 
 
 		 631 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.29 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.11 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.97 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  24.22 
 
 		 214 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  21.96 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>