38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1781 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 
489 aa  995    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  31.53 
 
 
340 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  34.11 
 
 
367 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  30.83 
 
 
472 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  32.64 
 
 
396 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  29.84 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  29.03 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  32.72 
 
 
365 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  30.92 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  31.34 
 
 
345 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  29.17 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  30.22 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  28.79 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  31.75 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  29.82 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  28.41 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  27.93 
 
 
548 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  27.16 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.87 
 
 
830 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.56 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.7 
 
 
433 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.8 
 
 
1888 aa  53.5  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.58 
 
 
257 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.66 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  31.85 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  36 
 
 
383 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0543  SH3 type 3 domain protein  26.61 
 
 
153 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.33 
 
 
1776 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.27 
 
 
522 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  33.62 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.82 
 
 
450 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  35.85 
 
 
379 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  32.38 
 
 
309 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  28.81 
 
 
1281 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  37.93 
 
 
671 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  35.63 
 
 
778 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  42.5 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  41.57 
 
 
356 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>