18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3386 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  100 
 
 		 365 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  74.49 
 
 		 372 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  68.72 
 
 		 377 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  67.2 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  66.22 
 
 		 388 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  81.31 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  66.46 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  49.86 
 
 		 345 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  52.69 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  38.37 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  32.32 
 
 		 483 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  30.74 
 
 		 492 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  31.8 
 
 		 548 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 567 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  29.1 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 594 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  30.83 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>