18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0735 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  87.75 
 
 
400 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  801    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  72.43 
 
 
372 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  66.76 
 
 
365 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  64.71 
 
 
377 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  62.63 
 
 
396 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  63.11 
 
 
472 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  49.43 
 
 
345 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  57.3 
 
 
351 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  37.6 
 
 
367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  33.45 
 
 
483 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  29.1 
 
 
492 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  31.42 
 
 
548 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  30.69 
 
 
548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  30.38 
 
 
567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  30.22 
 
 
340 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  29.84 
 
 
489 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  26.79 
 
 
594 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>