19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1466 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1078    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  40.64 
 
 
567 aa  320  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  52.12 
 
 
483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  48.62 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  50.59 
 
 
594 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  45.45 
 
 
492 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  34.15 
 
 
367 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  35.88 
 
 
472 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  31.8 
 
 
396 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  31.8 
 
 
365 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  31.42 
 
 
388 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  29.85 
 
 
345 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  30.27 
 
 
400 aa  127  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  30.27 
 
 
377 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  29.5 
 
 
372 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  28.37 
 
 
351 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  26.12 
 
 
340 aa  87  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  28.79 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01546  pyruvate-formate lyase  29.41 
 
 
758 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>