19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2240 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  100 
 
 
594 aa  1130    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  51.55 
 
 
567 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  55.38 
 
 
548 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  53.14 
 
 
483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  40.51 
 
 
492 aa  310  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  50.59 
 
 
548 aa  303  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  31.87 
 
 
367 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  28.19 
 
 
396 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  27.8 
 
 
472 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  24.71 
 
 
345 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  27.82 
 
 
365 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  26.54 
 
 
351 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  27.03 
 
 
377 aa  97.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  26.79 
 
 
388 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  28.35 
 
 
340 aa  94  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  26.04 
 
 
400 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  26.25 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2738  hypothetical protein  31.85 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.156237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  27.16 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>