18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2390 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  769    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  72.75 
 
 		 365 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  65.98 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  68.83 
 
 		 377 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  66.5 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  65.59 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  61.86 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  60.95 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  58.02 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  37.6 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  30.66 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  29.8 
 
 		 492 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 567 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  29.5 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  30.92 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>