More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1624 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 738 aa  1496    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.45 
 
 		 701 aa  289  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 646 aa  283  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  28.65 
 
 		 661 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.48 
 
 		 639 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.37 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 		 678 aa  253  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.11 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 636 aa  250  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 609 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  28 
 
 		 623 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  28 
 
 		 623 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 643 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 		 627 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  28 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  26.88 
 
 		 801 aa  241  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 		 623 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  27.72 
 
 		 623 aa  240  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  28.37 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  26.84 
 
 		 801 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 645 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31 
 
 		 615 aa  238  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 612 aa  238  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  26.7 
 
 		 801 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  27.47 
 
 		 643 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  27.56 
 
 		 679 aa  233  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 		 662 aa  233  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  27.82 
 
 		 633 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  232  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  27.01 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  27.51 
 
 		 634 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.05 
 
 		 619 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  26.41 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.89 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  27.86 
 
 		 617 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 		 767 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.08 
 
 		 771 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 		 709 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.28 
 
 		 800 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 		 627 aa  228  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.19 
 
 		 640 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 		 610 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  27.57 
 
 		 617 aa  227  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 		 618 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1188  penicillin-binding protein transpeptidase  28.47 
 
 		 767 aa  227  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  27.25 
 
 		 667 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 634 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  27.63 
 
 		 803 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  27.64 
 
 		 631 aa  226  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  27.64 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 809 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  28.38 
 
 		 618 aa  225  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 618 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 618 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 642 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.13 
 
 		 636 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.57 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  28.21 
 
 		 681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  25.69 
 
 		 664 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  27.5 
 
 		 631 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 		 630 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 703 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  24.5 
 
 		 586 aa  223  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  27.68 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  27.68 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 618 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 		 671 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  29.52 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  27.68 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  27.87 
 
 		 618 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  27.68 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 		 681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 		 618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  26.07 
 
 		 637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.26 
 
 		 761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>