39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0283 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 104 aa  207  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  50 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  47.92 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  47.92 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  47.87 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  44.57 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.38 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  46.67 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.58 
 
 		 105 aa  87.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.33 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.33 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.24 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  42.39 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  42.39 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  42.39 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  43.82 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  43.48 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  41.67 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  44.33 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  40.4 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  39 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  40.21 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.44 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  34.74 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  37.08 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  34.74 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.61 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  34.38 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  36.84 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  38.36 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.79 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  32.53 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  32.94 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  32.89 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  32.18 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.88 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.71 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>