64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0121 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0121  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0314427  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1367  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.508502 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1888  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.447196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0128  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.1714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0998  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0851489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.91 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.18 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.54 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  23.99 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  25.52 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  27 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  24.32 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  23 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  24.52 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  22.04 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.18 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  24.9 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  23.59 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  23.33 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  23.92 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  22.86 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  22.86 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  22.86 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0333  periplasmic solute binding protein  20.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  20.76 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  21.91 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.27 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  19.05 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  23.18 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  22.08 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  23.92 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  21.4 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  21.48 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  21.31 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  25.89 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  22.14 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.52 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.52 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.52 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  23.67 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  28.12 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  23.19 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.57 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.52 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.52 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  24.39 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  23.18 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  21.69 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.87 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  21.55 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.9 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>