More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3665 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  100 
 
 
251 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  52.71 
 
 
207 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  42.29 
 
 
247 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  37.77 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  36 
 
 
236 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.96 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
269 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  35.27 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4907  predicted protein  29.91 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27365  normal  0.859905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
506 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  45.26 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.58 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.25 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.25 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.49 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.76 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.76 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.59 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  35.17 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.43 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2700  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  37.93 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.57 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.87 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.19 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  44.12 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.13 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.44 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.44 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.44 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.43 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.74 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37.5 
 
 
658 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.44 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.44 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.37 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.14 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.36 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>