26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2350 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  49.73 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  43.82 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  33.77 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  29.35 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  31.72 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  29.27 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  32.26 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  28.83 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.54 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.26 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  25.75 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.51 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  26.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  27.72 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  27.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  26.55 
 
 		 197 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  24.22 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.06 
 
 		 193 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  27.53 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>