39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0156 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  100 
 
 		 525 aa  1085    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.16 
 
 		 521 aa  801    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.9 
 
 		 516 aa  805    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.21 
 
 		 520 aa  797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  71.95 
 
 		 516 aa  776    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.1 
 
 		 516 aa  807    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  74.1 
 
 		 516 aa  807    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  70.99 
 
 		 548 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.56 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.48 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.52 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.1 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.34 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.24 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  25.97 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  27.66 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  23.6 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 		 98 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  57.5 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.37 
 
 		 590 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  40.74 
 
 		 369 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 274 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0808  carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  57.89 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  29.2 
 
 		 530 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  29.38 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 537 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 		 530 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  45 
 
 		 109 aa  43.9  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 		 530 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  28.47 
 
 		 530 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  50 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  42 
 
 		 373 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>