More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0098 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 450 aa  884    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  39.32 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  39.12 
 
 		 482 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.61 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.6 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  37.29 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  38.24 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 581 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 552 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  32.82 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  36.53 
 
 		 544 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  36.05 
 
 		 567 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  31.45 
 
 		 557 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  31.09 
 
 		 557 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  33.23 
 
 		 597 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 605 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  34.14 
 
 		 579 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  37.09 
 
 		 801 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  37.37 
 
 		 608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  36.12 
 
 		 558 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  32.08 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  34.32 
 
 		 586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  28.48 
 
 		 554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 539 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  29.07 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.74 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  33.74 
 
 		 594 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 524 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  33.61 
 
 		 648 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.15 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  36.13 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 504 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 483 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  25.77 
 
 		 603 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 601 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  32.28 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 640 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  25.15 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  25.47 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  25.48 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  25.47 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  32.84 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  25.94 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 604 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.28 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.3 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.27 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 603 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 469 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  33.96 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  24.38 
 
 		 617 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  30.37 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>