35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1418 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
863 aa  1754    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  88.99 
 
 
868 aa  1529    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  78.73 
 
 
867 aa  1411    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  83.88 
 
 
878 aa  1406    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  29.57 
 
 
820 aa  362  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  29.18 
 
 
919 aa  282  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  30.47 
 
 
895 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  30.01 
 
 
701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
903 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  27.99 
 
 
843 aa  212  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  29.6 
 
 
862 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  27.27 
 
 
871 aa  199  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
868 aa  191  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  27.87 
 
 
612 aa  174  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
607 aa  54.7  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  21.88 
 
 
516 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
578 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 
524 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
543 aa  48.9  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  27.78 
 
 
198 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
544 aa  48.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  23.17 
 
 
509 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
579 aa  46.2  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.54 
 
 
595 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
579 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
531 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 
580 aa  45.8  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  20.59 
 
 
544 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
587 aa  45.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
640 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 
1437 aa  44.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.05 
 
 
548 aa  44.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 
525 aa  44.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>