67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0749 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
276 aa  521  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  77.9 
 
 
276 aa  424  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  74.18 
 
 
275 aa  370  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  69.34 
 
 
290 aa  333  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  38.77 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  37.99 
 
 
277 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  35.09 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  33.17 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  36.17 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  37.02 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.1 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  31.75 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  33.5 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.68 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  34.73 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  33.16 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  34.59 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  29.13 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.57 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  39.73 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.7 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.38 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  33.78 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.7 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  30.52 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  31.58 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  26.58 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  27.89 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  25.87 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  29.41 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  34.48 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.73 
 
 
303 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  35.14 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  32.49 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  26.5 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  26.25 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  25.6 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  22.67 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1594  UbiA prenyltransferase  36 
 
 
309 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  26.22 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  26.22 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  27.81 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  30.25 
 
 
185 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.71 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.91 
 
 
303 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  26.59 
 
 
314 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.74 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.48 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.3 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  24.71 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.79 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.9 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.33 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  28.28 
 
 
494 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  30.85 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  22.47 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  23.86 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.61 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.33 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.57 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  24.55 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.62 
 
 
315 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 
337 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.76 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  25.24 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.22 
 
 
330 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>