73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0192 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  100 
 
 		 97 aa  193  7e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  87.63 
 
 		 97 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  87.63 
 
 		 99 aa  178  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  88.54 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.685193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  48.45 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  45.88 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  43.53 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  41.18 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  42.35 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  41.25 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  41.03 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  40 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  41.11 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  39.47 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  38.82 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  37.5 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  45.33 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  38.64 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  43.02 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  39.77 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  39.77 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  39.77 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  36.36 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  42.86 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  38.96 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  38.64 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  38.75 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  35.37 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  37.66 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  37.5 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  34.15 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  38.24 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  35.29 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  35.06 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  35.06 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  38.96 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  39.29 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  29.49 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  35.29 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  30.88 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  35.29 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  28.21 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  35.71 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  35.71 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  34.67 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  33.77 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  37.5 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  35.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  37.31 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0625  translation initiation factor IF-1  35.94 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0646  translation initiation factor IF-1  35.94 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  39.06 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  37.31 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  35.82 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  34.33 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  37.5 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  35.82 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  35.94 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  31.75 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1212  translation initiation factor IF-1  34.33 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  31.75 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2961  translation initiation factor IF-1  32.81 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0227177  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2388  translation initiation factor IF-1  32.81 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  32.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  32.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  32.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0211  translation initiation factor IF-1  34.38 
 
 		 72 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  32.79 
 
 		 72 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  34.33 
 
 		 73 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  32.79 
 
 		 72 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  34.33 
 
 		 73 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>