48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1938 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  100 
 
 
69 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  85.51 
 
 
113 aa  133  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  76.81 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  73.91 
 
 
84 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  72.46 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  72.46 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  72.46 
 
 
71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  72.46 
 
 
76 aa  97.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  62.32 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  66.67 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  58.57 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  58.57 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  55.71 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  57.14 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  57.14 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  55.71 
 
 
105 aa  87.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  50.72 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  55.07 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  47.83 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  52.86 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  50.72 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  52.94 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  59.65 
 
 
60 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  47.83 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  54.41 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  52.17 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  50.72 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  50 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  46.38 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  50.72 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  50 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  49.25 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  54.39 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  52.63 
 
 
59 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  52.73 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  55.36 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  50.91 
 
 
108 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  37.5 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  43.08 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  40.68 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  41.54 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  40.68 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  40.68 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  38.98 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  33.82 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  35.29 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  36.76 
 
 
97 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.685193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  35.29 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.968309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>