48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0169 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  61.11 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  64.37 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  59.77 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  60.92 
 
 		 101 aa  120  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  62.5 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  62.79 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  60.47 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  62.79 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  62.07 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  62.07 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  59.3 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  55.81 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  55.95 
 
 		 84 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  56.82 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  55.68 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  55.17 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  55.17 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  60 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  80 
 
 		 60 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  63.77 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  51.14 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  49.43 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  62.32 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  48.28 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  50.62 
 
 		 83 aa  93.2  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  57.89 
 
 		 76 aa  92  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  47.5 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  71.19 
 
 		 60 aa  90.5  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  67.8 
 
 		 59 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  48.05 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  43.68 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  45.98 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  46.67 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  46.15 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  48.78 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  40.91 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  43.04 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  50.79 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  42.31 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  36.9 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  35.8 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  35.29 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  35.29 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  34.57 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  39.77 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.685193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  41.25 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.968309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>