48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1786 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  100 
 
 		 60 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  83.05 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  76.27 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  81.03 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  80 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  79.66 
 
 		 59 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  77.97 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  70 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  66.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  67.8 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  69.49 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  69.49 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  61.4 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  63.16 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  58.62 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  61.4 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  59.65 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  60.34 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  58.62 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  57.89 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  54.24 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  52.54 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  51.72 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  54.24 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  50 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  63.16 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  50 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  48.28 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  60.34 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  51.72 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  51.72 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  49.12 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  46.55 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  49.12 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  51.92 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  52.83 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  52.08 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  42.86 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  41.07 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  44.83 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  48.08 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  37.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  43.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  43.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0140757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  39.66 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  37.29 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  39.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.685193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>