48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1257 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  100 
 
 
71 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  81.16 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  82.61 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  78.26 
 
 
113 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  79.71 
 
 
84 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  75.36 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  72.46 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  82.61 
 
 
76 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  76.81 
 
 
102 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  63.77 
 
 
90 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  62.5 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  59.15 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  60.56 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  59.15 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  57.75 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  49.28 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  54.93 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  53.52 
 
 
95 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  54.93 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  50 
 
 
115 aa  87  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  52.17 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  61.4 
 
 
60 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  47.83 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  51.43 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  52.17 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  47.89 
 
 
104 aa  84  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  48.61 
 
 
103 aa  84  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  47.83 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  46.38 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  45.07 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  43.48 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  50.88 
 
 
60 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  43.66 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  44.78 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  50.88 
 
 
59 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  43.66 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  42.03 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  50.88 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  40.85 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  39.06 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  39.71 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  39.71 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  37.68 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  37.68 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0140757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  35.21 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  38.24 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  38.24 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.685193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>