48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2537 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2537  translation initiation factor IF-1A  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0313207  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0456  translation initiation factor IF-1A  83.33 
 
 		 106 aa  166  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2540  translation initiation factor IF-1A  82.61 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.699879  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0169  translation initiation factor eIF-1A  64.37 
 
 		 90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0595  translation initiation factor IF-1A  57.89 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1003  translation initiation factor IF-1A  57.89 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.487118  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0289  translation initiation factor IF-1A  57.61 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1625  translation initiation factor IF-1A  57.61 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1475  translation initiation factor IF-1A  55.32 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2160  translation initiation factor IF-1A  86.44 
 
 		 59 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0156521  normal  0.787294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2366  translation initiation factor IF-1A  81.36 
 
 		 60 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143928  normal  0.0530034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1786  translation initiation factor IF-1A  83.05 
 
 		 60 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0621  translation initiation factor IF-1A  43.62 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0140  translation initiation factor IF-1A  43.62 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2969  translation initiation factor IF-1A  44.44 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1279  translation initiation factor eIF-1A  50 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1550  translation initiation factor IF-1A  47.19 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.812328  decreased coverage  0.00000482872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1606  translation initiation factor IF-1A  46.81 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1228  translation initiation factor IF-1A  48.19 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1873  translation initiation factor eIF-1A  49.38 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0702  translation initiation factor eIF-1A  47.13 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.747036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0057  translation initiation factor eIF-1A  46.91 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0138  translation initiation factor eIF-1A  42.55 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0548  translation initiation factor IF-1A  48.81 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.221124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1257  translation initiation factor IF-1A  47.83 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2368  translation initiation factor IF-1A  43.68 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.529571 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0526  translation initiation factor eIF-1A  41.38 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0777  S1 IF1 family protein  45.68 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0748043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0655  translation initiation factor IF-1A  44.16 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0503733  normal  0.160128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1938  translation initiation factor IF-1A  47.83 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1849  translation initiation factor IF-1A  46.25 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0438974  normal  0.244993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2847  S1 IF1 family protein  44.3 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1000  S1 IF1 family protein  44.16 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275508  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0681  translation initiation factor IF-1A  42.05 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0732749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1348  translation initiation factor eIF-1A  35.42 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2378  translation initiation factor IF-1A  46.05 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0187  translation initiation factor eIF-1A  39.53 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0570057  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1256  translation initiation factor IF-1A  39.77 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0400  S1 IF1 family protein  42.5 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0424  translation initiation factor eIF-1A  45.59 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8976  predicted protein  40.74 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.869053  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_8958  translation initiation factor eIF1A  35.8 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89884  predicted protein  39.51 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248522  hitchhiker  0.00319635 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13193  predicted protein  39.51 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0140757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08712  eukaryotic translation initiation factor eIF-1A subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02520)  38.27 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01170  conserved hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697693  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0192  translation initiation factor IF-1A  38.64 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.968309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0278  translation initiation factor IF-1A  36.36 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.685193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>