More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1324 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  100 
 
 
402 aa  812    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  44.58 
 
 
421 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  44.16 
 
 
416 aa  311  9e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  41.25 
 
 
414 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  41.04 
 
 
419 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  37.85 
 
 
422 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  37.4 
 
 
405 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  35.36 
 
 
402 aa  252  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  40.79 
 
 
404 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  34.3 
 
 
401 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  37.99 
 
 
404 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.04 
 
 
401 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  37.73 
 
 
403 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  33.5 
 
 
399 aa  242  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  37.47 
 
 
404 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.42 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.77 
 
 
402 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.04 
 
 
401 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  35.19 
 
 
394 aa  223  6e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  35.45 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  33.42 
 
 
408 aa  219  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  35.47 
 
 
391 aa  219  7e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  33.16 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  34.12 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  33.25 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  34.29 
 
 
422 aa  213  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.32 
 
 
414 aa  210  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  37.43 
 
 
348 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  34.69 
 
 
432 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  34.69 
 
 
432 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  33.68 
 
 
434 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  37.43 
 
 
348 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  39.61 
 
 
346 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  36.9 
 
 
354 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  37.01 
 
 
351 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  36.84 
 
 
356 aa  205  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  36.51 
 
 
396 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  35.33 
 
 
360 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  32.9 
 
 
454 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  34.11 
 
 
404 aa  204  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  38.07 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  33.88 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.31 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  36.6 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.79 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  38.37 
 
 
348 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.99 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  34.72 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  30.64 
 
 
426 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  31.03 
 
 
424 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  38.31 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  39.64 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  38.31 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  37.16 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  39.64 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  38.59 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  38.82 
 
 
368 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  32.21 
 
 
423 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  36.89 
 
 
331 aa  196  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  38.03 
 
 
352 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  38.03 
 
 
352 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  35.67 
 
 
353 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  38.03 
 
 
352 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  35.67 
 
 
353 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  29.64 
 
 
425 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  39.24 
 
 
377 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  37.6 
 
 
368 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  33.83 
 
 
360 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  36.93 
 
 
403 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  33.83 
 
 
360 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  33.83 
 
 
360 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  36.07 
 
 
367 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  38.03 
 
 
352 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  37.75 
 
 
352 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  36.84 
 
 
363 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  30.32 
 
 
439 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  30.77 
 
 
416 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  39.17 
 
 
368 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  34.12 
 
 
359 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  30.83 
 
 
428 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  30.9 
 
 
411 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  35.49 
 
 
349 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  34.5 
 
 
366 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  36.36 
 
 
371 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.17 
 
 
427 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  39.16 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  36.62 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  37.64 
 
 
352 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  36.62 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  34.73 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  36.02 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  36.49 
 
 
348 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  35.57 
 
 
352 aa  189  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  37.2 
 
 
353 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  35.77 
 
 
345 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  36.86 
 
 
353 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  36.12 
 
 
366 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  35.41 
 
 
367 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  36.27 
 
 
367 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  37.18 
 
 
352 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>