33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2842 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  73.57 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  72.38 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  72.27 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  62.14 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  72.22 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  63.37 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  63.79 
 
 		 239 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  63.31 
 
 		 245 aa  295  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  65.91 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  60.32 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  64.86 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  60.68 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  65.74 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  61.09 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  62.14 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  55.17 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  60.5 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  51.79 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  41.32 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  39.83 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  39.58 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  39.06 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  40.25 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  39.83 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  36.75 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  33.06 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  29.82 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  29.74 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  29.59 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>