60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1620 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  35.42 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  35.43 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  38.15 
 
 		 176 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  35 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  33.51 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  33.51 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  33.51 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  32.34 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  33.97 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  34.04 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  33.7 
 
 		 1097 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  35.59 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  29.95 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  33.16 
 
 		 203 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  32 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  41.79 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  33.15 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  31.21 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  35.59 
 
 		 176 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  33.68 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  33.14 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  40.24 
 
 		 184 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  36.3 
 
 		 185 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  36.3 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  36.3 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  33.53 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  33.71 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  30.21 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  43.8 
 
 		 137 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  32.2 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  37.5 
 
 		 184 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  36.59 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  44.04 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  35.66 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  40.98 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  34.66 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  31.43 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  35.09 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  27.8 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  33.04 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  33.04 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4537  putative phage tail protein  25.96 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  30.77 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4453  putative phage tail protein  26.9 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  36.96 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4538  putative phage tail protein  26.9 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1863  phage tail protein I  30.48 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2298  phage tail protein I  33.91 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  37.5 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0686  phage tail protein I  41.43 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3330  Phage tail protein I  35.71 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  34.18 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  42.62 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  40.98 
 
 		 346 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0232  phage tail protein, putative  22.02 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2510  hypothetical protein  20 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  26.55 
 
 		 649 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  21.78 
 
 		 213 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>