18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0958 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 439 aa  902    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.72 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  28.75 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  26.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  30.52 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  30.52 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  29.3 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  34.12 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.37 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  35.11 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  34.12 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  24.5 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  28.78 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.12 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  24.52 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  25.83 
 
 		 273 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  30.13 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>