162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0555 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0555  peptidase T2 asparaginase 2  100 
 
 
283 aa  550  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5681  peptidase T2 asparaginase 2  46.48 
 
 
307 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2511  asparaginase  49.31 
 
 
304 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0550  peptidase T2, asparaginase 2  47.24 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0874  Asparaginase  48.12 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  50 
 
 
300 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4448  peptidase T2 asparaginase 2  46.32 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  50.35 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0104  asparaginase  45 
 
 
325 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203772  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1503  asparaginase  48.49 
 
 
310 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.606949  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2366  peptidase T2, asparaginase 2  50.71 
 
 
300 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.532674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0343  asparaginase  43.47 
 
 
334 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.303998  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2284  asparaginase  46.18 
 
 
301 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  44.7 
 
 
338 aa  201  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  39.68 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1000  peptidase T2, asparaginase 2  43.19 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.918613  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0839  Asparaginase  43.41 
 
 
329 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  42.31 
 
 
320 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  38.02 
 
 
353 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2882  peptidase T2 asparaginase 2  46.85 
 
 
300 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  42.31 
 
 
320 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  43 
 
 
320 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  43.88 
 
 
338 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  46.5 
 
 
321 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  43.34 
 
 
338 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  36.83 
 
 
363 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  43 
 
 
333 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  42.43 
 
 
317 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  46.76 
 
 
325 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  43.71 
 
 
320 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  42.53 
 
 
328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  42.81 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  41.16 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  40.51 
 
 
426 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  42.81 
 
 
321 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5802  Asparaginase  45.15 
 
 
290 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160809  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  42.81 
 
 
321 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  42.76 
 
 
313 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  43.28 
 
 
335 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  42.81 
 
 
320 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  42.47 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  42.47 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  42.47 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  44.04 
 
 
320 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  43.75 
 
 
339 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  42.12 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  41.89 
 
 
312 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  41.61 
 
 
312 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  41.78 
 
 
321 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  41.39 
 
 
319 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  44.48 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  39.59 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  42.76 
 
 
335 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  41.72 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  36.39 
 
 
356 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  40.38 
 
 
324 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  39.94 
 
 
354 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  41.55 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  41.06 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  35.79 
 
 
344 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  41.78 
 
 
313 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  40.32 
 
 
328 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  41.53 
 
 
324 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  41.78 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  41.78 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  41.78 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  42.81 
 
 
353 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  42.31 
 
 
287 aa  166  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  44.88 
 
 
315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  37.5 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  41.44 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  43.23 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0970  asparaginase  42.61 
 
 
299 aa  163  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  44.44 
 
 
307 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  39.26 
 
 
311 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  47.37 
 
 
318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  42.3 
 
 
329 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  39.87 
 
 
333 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  41.99 
 
 
321 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  42.76 
 
 
322 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  40.88 
 
 
307 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  37.8 
 
 
340 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  37.58 
 
 
344 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  41.9 
 
 
330 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  40.95 
 
 
330 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  40.12 
 
 
335 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  34.97 
 
 
343 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  40.12 
 
 
335 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  38.41 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  38.41 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  38.31 
 
 
343 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  40.3 
 
 
342 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  36.88 
 
 
352 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0685  asparaginase  40.89 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000125075  hitchhiker  0.00000480758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0841  peptidase T2, asparaginase 2  38.89 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0241513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  38.13 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  37.38 
 
 
339 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  38.38 
 
 
343 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  38.38 
 
 
343 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  36.12 
 
 
348 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>