171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2920 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  55.56 
 
 		 319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  48.05 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  49.57 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.84 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  39.74 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  32.28 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  34.07 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  27.5 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  30.19 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.85 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  33.04 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.05 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  29.08 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  33.48 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.67 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  35.1 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.06 
 
 		 517 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  27.83 
 
 		 261 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  28.22 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  28.5 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.4 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.25 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.89 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  26.21 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  27.19 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  25.65 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.58 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.76 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  26.88 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.37 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.19 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.86 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.09 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  26.05 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.32 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.92 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  25.4 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  26.97 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  26.47 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.81 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  26.97 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  26.97 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.69 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  24.26 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.79 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  26.97 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.2 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  27.31 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.97 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  26.55 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.55 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.61 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.4 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.4 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.4 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.49 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  26.76 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.52 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  26.42 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  25.82 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.48 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.16 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  28.3 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.95 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.57 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.49 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.23 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  25.3 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  23.67 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  27.87 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.8 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.04 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  27.49 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.24 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.29 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  26.98 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.03 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  26.22 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.79 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.73 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.78 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.09 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.01 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  24.9 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.05 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>