69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2833 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  59.97 
 
 		 679 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  63.91 
 
 		 712 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  66.12 
 
 		 700 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  61.37 
 
 		 668 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  100 
 
 		 748 aa  1443    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  49.11 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  48.55 
 
 		 681 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  49.24 
 
 		 688 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  49.39 
 
 		 688 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  48.43 
 
 		 644 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  46.58 
 
 		 672 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  45.87 
 
 		 667 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  32.87 
 
 		 695 aa  303  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  32.03 
 
 		 568 aa  144  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  28.45 
 
 		 592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  28.45 
 
 		 592 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  28.45 
 
 		 592 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  28.95 
 
 		 587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  28.48 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  28.48 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  28.48 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  29.53 
 
 		 585 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  28.48 
 
 		 592 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  29.45 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  28.85 
 
 		 553 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  30.05 
 
 		 585 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  30.24 
 
 		 595 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 		 553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  29.45 
 
 		 604 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  28.63 
 
 		 553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  27.89 
 
 		 592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  28.63 
 
 		 553 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  28.63 
 
 		 549 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  28.63 
 
 		 553 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 		 553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  28.41 
 
 		 542 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  29.61 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  27.89 
 
 		 590 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  32.86 
 
 		 569 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  27.68 
 
 		 589 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  28.72 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  30.94 
 
 		 562 aa  124  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  28.21 
 
 		 559 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  28.21 
 
 		 559 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  27.19 
 
 		 744 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  28.21 
 
 		 559 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  28.21 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  27.96 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  28.48 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  26.28 
 
 		 542 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  29.5 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  26.57 
 
 		 672 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  30 
 
 		 964 aa  104  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  24 
 
 		 693 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  23.92 
 
 		 475 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  23.95 
 
 		 507 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.29 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  23.29 
 
 		 524 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.29 
 
 		 524 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  23.29 
 
 		 524 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  23.29 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  23.29 
 
 		 524 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.29 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  23.29 
 
 		 524 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  22.89 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  23.74 
 
 		 482 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  23.11 
 
 		 519 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  22.89 
 
 		 524 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  23.39 
 
 		 601 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>