More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1926 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  634    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  76.13 
 
 
311 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  77.05 
 
 
308 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  72.03 
 
 
311 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  69.65 
 
 
316 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  69.35 
 
 
309 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  68.81 
 
 
308 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  71.84 
 
 
305 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  69.55 
 
 
310 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  66.03 
 
 
309 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  65.4 
 
 
312 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  65.71 
 
 
309 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  66.35 
 
 
313 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  63.87 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  68.06 
 
 
307 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  63.67 
 
 
306 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  69.45 
 
 
311 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.23 
 
 
306 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  60.06 
 
 
316 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  59.42 
 
 
316 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  64.52 
 
 
307 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  61.41 
 
 
308 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  64.04 
 
 
321 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  64.42 
 
 
311 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  61.09 
 
 
309 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  57.51 
 
 
316 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  57.88 
 
 
310 aa  350  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  54.92 
 
 
317 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  41.25 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 
307 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  38.11 
 
 
305 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  40.17 
 
 
281 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.47 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  33.77 
 
 
310 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  38.02 
 
 
287 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  36.13 
 
 
285 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  36.13 
 
 
285 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.02 
 
 
286 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  35.77 
 
 
285 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.44 
 
 
321 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 
316 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
343 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  31.86 
 
 
294 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  34.46 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.66 
 
 
292 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  31.82 
 
 
338 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  31.82 
 
 
338 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.6 
 
 
328 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  39.81 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  39.81 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  31.52 
 
 
338 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  32.48 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.65 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  34.77 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  32 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  35.69 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
282 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  31.58 
 
 
313 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  31.58 
 
 
313 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  31.48 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  31.25 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  30.36 
 
 
330 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
327 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.85 
 
 
347 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  31.97 
 
 
294 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
296 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  37.56 
 
 
288 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.27 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  40.76 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.61 
 
 
309 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.69 
 
 
330 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  36.49 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  30.65 
 
 
309 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  30.65 
 
 
309 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  30.65 
 
 
309 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  32.99 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  32.39 
 
 
287 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  34.01 
 
 
484 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  32.28 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  31.54 
 
 
327 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.74 
 
 
330 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  39.11 
 
 
299 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  34.3 
 
 
325 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.19 
 
 
265 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 
374 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 
339 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.39 
 
 
310 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>