More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1520 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1520  thiolase  100 
 
 		 393 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  80.92 
 
 		 393 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  81.68 
 
 		 393 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  77.52 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  53.73 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  49.49 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  49.23 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 		 394 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  50 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  50 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  50 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  50 
 
 		 427 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 		 393 aa  358  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  50 
 
 		 427 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  52.15 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  49.74 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  49.74 
 
 		 427 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  51.9 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  49.49 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  48.35 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  49.36 
 
 		 392 aa  355  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  51.65 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.48 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  50.75 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  51.54 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  48.97 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  47.95 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  48.97 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  48.59 
 
 		 421 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  48.46 
 
 		 394 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 398 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 		 392 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  50.64 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.64 
 
 		 391 aa  348  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  47.44 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  51.65 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  47.29 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 		 390 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  50.64 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  47.95 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  47.95 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  50.76 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  48.21 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  50.39 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 392 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  48.59 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 		 395 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 401 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 392 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  47.44 
 
 		 395 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  51.16 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 392 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>