More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1274 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  951    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  37.08 
 
 
450 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  37.14 
 
 
421 aa  262  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  35.59 
 
 
449 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  35.31 
 
 
448 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  34.07 
 
 
406 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  33.33 
 
 
451 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4160  cytochrome P450  33.83 
 
 
456 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  33.25 
 
 
451 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5024  cytochrome P450  33.25 
 
 
451 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  35.31 
 
 
407 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3680  cytochrome P450  34.07 
 
 
457 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3693  cytochrome P450  34.07 
 
 
457 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452097  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3753  cytochrome P450  34.07 
 
 
457 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821382  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  35.96 
 
 
412 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2498  cytochrome P450  32.93 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  36.76 
 
 
406 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  33.33 
 
 
418 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  34.33 
 
 
405 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  33.07 
 
 
390 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  29.19 
 
 
397 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.72 
 
 
392 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.16 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  32.99 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  32.26 
 
 
399 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.76 
 
 
404 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.76 
 
 
404 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.88 
 
 
403 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.51 
 
 
404 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.43 
 
 
398 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  34.23 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  30.75 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  30.92 
 
 
401 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.82 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32 
 
 
398 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.66 
 
 
406 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.32 
 
 
406 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  29.08 
 
 
406 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.04 
 
 
401 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  31.6 
 
 
398 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.67 
 
 
418 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  30.69 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  32.32 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  31.9 
 
 
417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  31.55 
 
 
399 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  30.23 
 
 
396 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  28.4 
 
 
417 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  32.01 
 
 
413 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  32.26 
 
 
417 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  29.55 
 
 
418 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  31.08 
 
 
398 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.83 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.83 
 
 
404 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  30.83 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.33 
 
 
411 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0361  cytochrome P450  32.19 
 
 
406 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.09 
 
 
395 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.07 
 
 
411 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  32.94 
 
 
408 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  32.96 
 
 
420 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  32.96 
 
 
420 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  32.96 
 
 
420 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.03 
 
 
411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.7 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  33.82 
 
 
405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.03 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  31.67 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  31.29 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  31.67 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  31.29 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  31.29 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  31.32 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  28.74 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.45 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.45 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  31.13 
 
 
412 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  33.62 
 
 
428 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  34.35 
 
 
1046 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  32.85 
 
 
398 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  31.8 
 
 
424 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  31.8 
 
 
424 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  32.85 
 
 
398 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  31.8 
 
 
424 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  32.94 
 
 
416 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.47 
 
 
411 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  30.21 
 
 
412 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  28.2 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  31 
 
 
424 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.94 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  31.59 
 
 
394 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  28.92 
 
 
396 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.34 
 
 
418 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  31.17 
 
 
404 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  31.59 
 
 
411 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  32 
 
 
409 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  29.54 
 
 
449 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  31.84 
 
 
394 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  32.22 
 
 
401 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>