32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0837 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  50 
 
 
442 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  40.24 
 
 
172 aa  91.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  46.22 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  31.46 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  36.44 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  26.42 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  37.7 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  62  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  38.21 
 
 
113 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  34.65 
 
 
139 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  40.48 
 
 
125 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  34.45 
 
 
116 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32.5 
 
 
113 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  34.45 
 
 
116 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  31.78 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  35.96 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.77 
 
 
2914 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  30.71 
 
 
123 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  30.71 
 
 
123 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  27.83 
 
 
127 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  37.36 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  28.46 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  34.85 
 
 
122 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  29.35 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0339  GGDEF domain protein  34.09 
 
 
677 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  34.02 
 
 
888 aa  41.6  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>