More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0338 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  100 
 
 		 366 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  67.21 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  53.09 
 
 		 351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  58.03 
 
 		 353 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  53.31 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  56.82 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  58.77 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  59.87 
 
 		 332 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  52.23 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  51.86 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  52.27 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  51.39 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  54.49 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  54.43 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  46.65 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  53.7 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  50.16 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  48.69 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  54.1 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  49.69 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  44.89 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  50.17 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  54.1 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  53.92 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  47 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  48.9 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.81 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  45.31 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  45.31 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  46.89 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  50.61 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  45.61 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  44.82 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  52.42 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  50.16 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  49.18 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  50.66 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.66 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.66 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.66 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  50.66 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.33 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.33 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  50.33 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  50.33 
 
 		 334 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  44.31 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.13 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  48.71 
 
 		 344 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  46.88 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  50.32 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  44.79 
 
 		 340 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.33 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  41.67 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.33 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.33 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  41.67 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  45.8 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  41.67 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  41.32 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  46.51 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  47 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  48.08 
 
 		 336 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.67 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  48.54 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  51.04 
 
 		 332 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  50.92 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.82 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  39.57 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  53.09 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  48.11 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  46.08 
 
 		 335 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 334 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  37.61 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  40.27 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  40.79 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  47.3 
 
 		 347 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  49.83 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26540  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.51 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  42.51 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  49.71 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  39.12 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  50 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  49.02 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  49.1 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  44.48 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  38.8 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 351 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  45.36 
 
 		 343 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  38.46 
 
 		 351 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  38.46 
 
 		 351 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 351 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  45.34 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  38.14 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>