73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3439 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
381 aa  789    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.76 
 
 
372 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.31 
 
 
371 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  29.91 
 
 
371 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.23 
 
 
368 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.02 
 
 
371 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  27.3 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.33 
 
 
372 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.74 
 
 
371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  29.73 
 
 
376 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.34 
 
 
368 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.54 
 
 
372 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.63 
 
 
373 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.24 
 
 
373 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.24 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.13 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.24 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.89 
 
 
371 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.27 
 
 
371 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.47 
 
 
372 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.34 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  27.2 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.2 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  24.22 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.66 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.08 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.67 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.54 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.22 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.56 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.58 
 
 
370 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.67 
 
 
377 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.02 
 
 
370 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.07 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.83 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.68 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  25.8 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  25.83 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.95 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.84 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  26.52 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.42 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  23.85 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.06 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.28 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  24.92 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.28 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.28 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.11 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.1 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.1 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.1 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27.01 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.47 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.8 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.04 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  26.09 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.8 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  26.09 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  26.38 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  26.38 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  26.38 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  26.09 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.12 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  23.94 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  23.94 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.01 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  20.8 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  30 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.39 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.23 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>