48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1715 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 324 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  57.91 
 
 		 318 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.97 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.26 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.17 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.84 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.44 
 
 		 315 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  45.86 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  38.63 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  37.34 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.83 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.46 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.51 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  34.58 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  36.62 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.5 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  36 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  26.36 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.4 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.51 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.24 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.27 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  23.4 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.81 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  34.57 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.54 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.45 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  32.5 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.71 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  20.08 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4699  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.08 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.74 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.45 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>