98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0009 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 78 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0626  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00428468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R14  tRNA-Asx  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04010  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000945479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04380  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04300  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239342  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00420  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00120  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00563215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>