More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0031 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna16  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna14  tRNA-Glu  90.32 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.875319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0033  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.752576  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0031  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0034  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0633103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0068  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000000880968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039615  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000590087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347346  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000216886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000012811  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203047  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000126526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000157015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000053193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000296278  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000121359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000121548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163741  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0065  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000534255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000480253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000357048  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000128898  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119208  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000025462  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000669443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534013  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108915  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000656103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000345066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192747  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0062  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>