48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_918 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0016  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0017  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0031  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0747  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt018  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna16  tRNA-Glu  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna14  tRNA-Glu  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.875319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0030  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>