15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0016 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0017  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0568  tRNA-Phe  85.96 
 
 		 155 bp  50.1  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0011  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.619648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13120  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100259  normal  0.836167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>