65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0020 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0085  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  84 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08680  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0056  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000501155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0046  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>