134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0018 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  88.52 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04526  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000165609  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000216886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000128898  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000157015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000053193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2622  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00008673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000121359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000534255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119208  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000025462  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0028  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000039203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0031  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0093  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000098404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0095  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000570772  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0097  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000337615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000345066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000590087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000121548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000126526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000000880968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039615  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347346  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000357048  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534013  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108915  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163741  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0053  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000584224  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192747  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203047  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000669443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000656103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000296278  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000012811  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>