183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0056 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0056  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000501155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0001  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0096405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0038  tRNA-Glu  93.62 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000513604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08680  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5736  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0233  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00200909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5629  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000097671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5798  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4982  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00381544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0012905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000917456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000647652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5832  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5653  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0034  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000601251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000919023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5013  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0069  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5343  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183126  hitchhiker  0.00000000000862648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5248  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000518597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0115  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5575  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70531e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0014  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000839955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000517529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0085  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>